home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410o.zip / M94A2750.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  2KB  |  37 lines
  1.        Document 2750
  2.  DOCN  M94A2750
  3.  TI    Quantitation of HIV-1 proviruses in peripheral blood lymphocytes by
  4.        competitive nested PCR.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Hiraishi Y; Kato S; Asakawa M; Takano T; Department of Microbiology,
  7.        Keio University School of Medicine,; Tokyo, Japan.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):233 (abstract no. PB0360). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369825
  10.  AB    OBJECTIVE: To optimize the conditions of the competitive nested PCR
  11.        assay which is highly sensitive for quantitation of HIV-1 DNA. METHODS:
  12.        The target sequence was within the nef gene. The competitor DNA was
  13.        produced by an internal deletion of the parental HIV-1 DNA. Competitor
  14.        DNA with a known copy number was co-amplified with 1 microgram of DNA
  15.        from peripheral blood lymphocytes of infected individuals by two
  16.        sequential PCR using different pairs of primers. The ratio between the
  17.        wild-type and competitor DNA products are determined by densitometric
  18.        analysis of DNA bands on agarose gel electrophoresis. RESULTS: To ensure
  19.        that the ratio between the wild-type and competitor DNA products be
  20.        equal to the ratio of these DNA before amplification, the preheating and
  21.        the polymerization steps had to be long enough. In the case of sample
  22.        DNA, the amounts of wild-type DNA products were often gradually
  23.        increased with the annealing temperature decreased, which was thought to
  24.        be an effect of mismatches between primers and target DNA. Such an
  25.        effect can be erased by using an annealing temperature at least 16
  26.        degrees C below Tm of the primers. DISCUSSION AND CONCLUSIONS:
  27.        Competitive nested PCR is useful for accurate quantitation of HIV-1
  28.        nucleic acids with no need of radioisotope.
  29.  DE    Genes, nef/GENETICS  Human  HIV Infections/*MICROBIOLOGY
  30.        *HIV-1/GENETICS  Lymphocytes/*MICROBIOLOGY  Polymerase Chain
  31.        Reaction/*METHODS  *Proviruses/GENETICS  Viremia/*MICROBIOLOGY  MEETING
  32.        ABSTRACT
  33.  
  34.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  35.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  36.  
  37.